kegglincs

doi:10.18129/b9.bioc.kegglincs

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅kegglincs

可视化kegg途径中的所有边缘和覆盖lincs数据[选项]

生物导体版本:3.7

通过从KGML文件获得的信息中明确创建路径映射,查看KEGG路径的“引擎盖下方”的情况。

作者:Shana White

维护者:shana White ,Mario Meddedovic

引用(从r内,输入引用(“ kegglincs”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ kegglincs”)

文档

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html R脚本 kegglincs工作流程
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 细胞生物学,,,,datarepresentation,,,,基因表达,,,,GraphandNetwork,,,,kegg,,,,网络,,,,网络引导,,,,途径,,,,软件,,,,第三派对人
版本 1.6.2
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(2年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.3),科达塔,,,,HGU133A.DB,,,,org.hs.eg.db(> = 3.3.0)
进口 AnnotationDbi,,,,kegggraph,,,,Igraph,,,,plyr,,,,gtools,,,,httr,,,,rjsonio,,,,keggrest,方法,图形,统计,utils,XML,grdevices
链接
建议 Biocinstaller(> = 1.20.3),尼特,,,,图形
系统要求 Cytoscape(> = 3.3.0),Java(> = 8)
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 kegglincs_1.6.2.tar.gz
Windows二进制 kegglincs_1.6.2.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) kegglincs_1.6.2.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/kegglincs
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/kegglincs
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/kegglincs/
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