桅杆

doi:10.18129/b9.bioc.mast

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅桅杆

基于模型的单细胞转录组学分析

生物导体版本:3.7

处理零充气的单细胞测定数据的方法和模型。

作者:Andrew McDavid [AUT,CRE],Greg Finak [aut],Masanao Yajima [aut]

维护者:Andrew McDavid

引用(从r内,输入引用(“桅杆”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ mast”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“桅杆”)

html R脚本 桅杆介绍
html R脚本 使用桅杆进行过滤,差异表达和基因集富集在Mait细胞中
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 差异性,,,,基因表达,,,,基因烯,,,,rnaseq,,,,Singlecell,,,,软件,,,,转录组学
版本 1.6.1
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(2年)
执照 GPL(> = 2)
要看 Singlecellexperiment(> = 1.2.0),R(> = 3.5)
进口 生物酶,,,,生物基因,,,,S4VECTORS,,,,Data.Table,,,,GGPLOT2,,,,plyr,,,,Stringr,,,,艾宾,方法,并行,RESHAPE2,Stats,stats4,图形,utils,总结性特征(> = 1.5.3)
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,LME4(> = 1.0),roxygen2(> 4.0.0),numderiv,,,,,,,,gdata,,,,格子,,,,ggally,,,,gseabase,,,,NMF,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,RSVD,,,,林玛,,,,rcolorbrewer,,,,生物使用
系统要求
增强
URL https://github.com/rglab/mast/
BugReports https://github.com/rglab/mast/issues
取决于我
进口我 Singlecelltk
建议我 簇发酵
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 mast_1.6.1.tar.gz
Windows二进制 mast_1.6.1.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) mast_1.6.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mast
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/桅杆
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/mast/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户