此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见MSGFgui.
Bioconductor版本:3.7
这个包使得在GUI环境中使用MSGFplus包执行分析成为可能。此外,它允许用户使用交互式图表、汇总统计和过滤来调查结果。最后,它将当前结果暴露给另一个R会话,以便用户可以无缝地将gui集成到其他工作流中。
作者:Thomas Lin Pedersen
维护者:Thomas Lin Pedersen
引文(从R内,输入引用(“MSGFgui”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“MSGFgui”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“MSGFgui”)
超文本标记语言 | R脚本 | 使用MSGFgui |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GUI,MassSpectrometry,蛋白质组学,软件,可视化 |
版本 | 1.14.0 |
在Bioconductor | BioC 3.0 (R-3.1)(四年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | mzR,xlsx |
进口 | 闪亮的,mzID(> = 1.2),MSGFplus,shinyFiles(>= 0.4.0),工具 |
链接 | |
建议 | knitr,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | RforProteomics |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | MSGFgui_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | MSGFgui_1.14.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | MSGFgui_1.14.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MSGFgui |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MSGFgui |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/MSGFgui/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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