MSGFplus

DOI:10.18129 / B9.bioc.MSGFplus

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见MSGFplus．

R和MS-GF+之间的接口

Bioconductor版本:3.7

该软件包包含使用MS-GF+算法进行肽识别的功能。该包包含在代码中和通过简单的GUI构建参数集的功能，以及批量运行算法(可能是异步的)。

作者:Thomas Lin Pedersen

维护者:Thomas Lin Pedersen

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“MSGFplus”)

文档

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browseVignettes(“MSGFplus”)

超文本标记语言	R脚本	使用MSGFgui
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	MassSpectrometry，蛋白质组学，软件
版本	1.14.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(四年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	方法
进口	mzID，ProtGenerics
链接
建议	gWidgets，knitr，testthat
SystemRequirements	Java (>= 1.7)
增强了
URL
全靠我	蛋白质组学
进口我	MSGFgui
建议我	RforProteomics
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	MSGFplus_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	MSGFplus_1.14.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	MSGFplus_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MSGFplus
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MSGFplus
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MSGFplus/
软件包下载报告	下载数据