该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅MSNBase。
生物导体版本:3.7
MSNBase提供了质谱和蛋白质组学数据的操纵,处理和可视化的基础架构,从原始到定量和注释数据。
Author: Laurent Gatto, Johannes Rainer and Sebastian Gibb with contributions from Guangchuang Yu, Samuel Wieczorek, Vasile-Cosmin Lazar, Vladislav Petyuk, Thomas Naake, Richie Cotton, Arne Smits, Martina Fisher, Ludger Goeminne, Adriaan Sticker and Lieven Clement.
维护者:laurent Gatto
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browsevignettes(“ msnbase”)
html | R脚本 | “ MSNBase”开发的简短介绍 |
html | R脚本 | 基于MS的蛋白质组学的基本功能和类 |
html | R脚本 | MSNBase IO功能 |
html | R脚本 | MSNBASE2基准测试 |
html | R脚本 | MSNBase:centroding copers-Mode MS数据 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | DataImport,,,,基础设施,,,,质谱,,,,蛋白质组学,,,,QualityControl,,,,软件 |
版本 | 2.6.4 |
在生物导体中 | Bioc 2.8(R-2.13)(7。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 3.1),方法,生物基因(> = 0.7.1),生物酶(> = 2.15.2),MZR(> = 2.13.6),生物比较,,,,蛋白质(> = 1.9.1) |
进口 | iranges(> = 2.13.28),plyr,,,,预处理,,,,VSN,网格,Stats4,副词,,,,算,,,,pcamethods,,,,害怕(> = 1.16),mzid(> = 1.5.2),消化,,,,格子,,,,GGPLOT2,,,,S4VECTORS,,,,XML,,,,秤,,,,大量的,,,,RCPP |
链接 | RCPP |
建议 | 测试,,,,普里尔,,,,栅格,,,,微实验,,,,动物园,,,,尼特(> = 1.1.0),洛尔,,,,rdisop,,,,proloc,,,,prolocdata(> = 1.7.1),MSDATA(> = 0.19.3),roxygen2,,,,RGL,,,,rpx,,,,AnnotationHub,,,,生物使用(> = 2.5.19),rmarkDown,,,,IMPUTELCMD,,,,规范,,,,GPLOTS,,,,闪亮的,,,,马格里特,,,,总结性特征 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/lgatto/msnbase |
BugReports | https://github.com/lgatto/msnbase/issues |
取决于我 | MSMSEDA,,,,msmstests,,,,Procona,,,,proloc,,,,prolocdata,,,,Prolocgui,,,,蛋白质组学,,,,proteoqc,,,,rforpoteomics,,,,突触,,,,XCMS |
进口我 | 达帕尔,,,,Dapardata,,,,dep,,,,MSNID,,,,MSSTATSQC,,,,PBase,,,,蛋白质组学杂志,,,,rmassbank,,,,TopDownr |
建议我 | AnnotationHub,,,,生物室,,,,生物基因,,,,isobar,,,,MSDATA,,,,QCMetrics,,,,读取,,,,rpx |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | msnbase_2.6.4.4.tar.gz |
Windows二进制 | msnbase_2.6.4.4.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | msnbase_2.6.4.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/msnbase |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/msnbase |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/msnbase/ |
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