MSNBase

doi:10.18129/b9.bioc.msnbase

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅MSNBase

质谱和蛋白质组学的基础功能和类

生物导体版本:3.7

MSNBase提供了质谱和蛋白质组学数据的操纵,处理和可视化的基础架构,从原始到定量和注释数据。

Author: Laurent Gatto, Johannes Rainer and Sebastian Gibb with contributions from Guangchuang Yu, Samuel Wieczorek, Vasile-Cosmin Lazar, Vladislav Petyuk, Thomas Naake, Richie Cotton, Arne Smits, Martina Fisher, Ludger Goeminne, Adriaan Sticker and Lieven Clement.

维护者:laurent Gatto

引用(从r内,输入引用(“ MSNBase”)):

安装

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文档

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html R脚本 “ MSNBase”开发的简短介绍
html R脚本 基于MS的蛋白质组学的基本功能和类
html R脚本 MSNBase IO功能
html R脚本 MSNBASE2基准测试
html R脚本 MSNBase:centroding copers-Mode MS数据
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 DataImport,,,,基础设施,,,,质谱,,,,蛋白质组学,,,,QualityControl,,,,软件
版本 2.6.4
在生物导体中 Bioc 2.8(R-2.13)(7。5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.1),方法,生物基因(> = 0.7.1),生物酶(> = 2.15.2),MZR(> = 2.13.6),生物比较,,,,蛋白质(> = 1.9.1)
进口 iranges(> = 2.13.28),plyr,,,,预处理,,,,VSN,网格,Stats4,副词,,,,,,,,pcamethods,,,,害怕(> = 1.16),mzid(> = 1.5.2),消化,,,,格子,,,,GGPLOT2,,,,S4VECTORS,,,,XML,,,,,,,,大量的,,,,RCPP
链接 RCPP
建议 测试,,,,普里尔,,,,栅格,,,,微实验,,,,动物园,,,,尼特(> = 1.1.0),洛尔,,,,rdisop,,,,proloc,,,,prolocdata(> = 1.7.1),MSDATA(> = 0.19.3),roxygen2,,,,RGL,,,,rpx,,,,AnnotationHub,,,,生物使用(> = 2.5.19),rmarkDown,,,,IMPUTELCMD,,,,规范,,,,GPLOTS,,,,闪亮的,,,,马格里特,,,,总结性特征
系统要求
增强
URL https://github.com/lgatto/msnbase
BugReports https://github.com/lgatto/msnbase/issues
取决于我 MSMSEDA,,,,msmstests,,,,Procona,,,,proloc,,,,prolocdata,,,,Prolocgui,,,,蛋白质组学,,,,proteoqc,,,,rforpoteomics,,,,突触,,,,XCMS
进口我 达帕尔,,,,Dapardata,,,,dep,,,,MSNID,,,,MSSTATSQC,,,,PBase,,,,蛋白质组学杂志,,,,rmassbank,,,,TopDownr
建议我 AnnotationHub,,,,生物室,,,,生物基因,,,,isobar,,,,MSDATA,,,,QCMetrics,,,,读取,,,,rpx
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 msnbase_2.6.4.4.tar.gz
Windows二进制 msnbase_2.6.4.4.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) msnbase_2.6.4.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/msnbase
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/msnbase
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/msnbase/
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