冰毒

doi:10.18129/b9.bioc.methed

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅冰毒

用于鉴定小儿脑肿瘤亚型的DNA甲基化分类器工具

生物导体版本:3.7

将小儿肿瘤分类为生物定义的亚型是具有挑战性的,需要多面方法。为此,我们开发了基于DNA甲基化谱的诊断分类器。我们提供甲基苯丙胺作为一种易于使用的工具箱,可让研究人员和临床诊断医生测试单个样品以及大型同类群,用于小儿脑肿瘤的子类预测。The current version of MethPed can classify the following tumor diagnoses/subgroups: Diffuse Intrinsic Pontine Glioma (DIPG), Ependymoma, Embryonal tumors with multilayered rosettes (ETMR), Glioblastoma (GBM), Medulloblastoma (MB) - Group 3 (MB_Gr3), Group4(MB_GR3),WNT组(MB_WNT),SHH组(MB_SHH)和毛囊星形胶质细胞瘤(Piloastro)。

作者:Mohammad Tanvir Ahamed [AUT,TRL],Anna Danielsson [AUT],SzilárdNemes[Aut,TRL],HelenaCarén[AUT,CRE,CPH]

维护者:helenaCarén

引用(从r内,输入引用(“甲基”)):

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PDF 参考手册

细节

生物浏览 分类,,,,DNAMETHYLATY,,,,表观遗传学,,,,软件
版本 1.8.0
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(2。5年)
执照 GPL-2
要看 r(> = 3.0.0),生物酶
进口 Randomforest,grdevices,图形,统计
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源包 methed_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 methed_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) methed_1.8.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methped
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/冰毒
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/methped/
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