路径网

doi:10.18129/b9.bioc.pathnet

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅路径网

使用拓扑信息进行途径分析的R包装

生物导体版本:3.7

路径网使用基因的途径和差异表达水平(从微阵列实验获得)中存在拓扑信息,以识别1)显着富集和2)在差异表达的背景下相互关联的途径。该算法在:PathNet:使用拓扑信息进行途径分析的工具中描述。Dutta B,Wallqvist A和Reifman J.生物学和医学的源代码2012年9月24日; 7(1):10。

作者:bhaskar dutta ,anders wallqvist ,jaques reifman >>

维护者:Jason B. Smith

引用(从r内,输入引用(“路径网”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ pathnet”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ pathnet”)

PDF R脚本 路径网
PDF 参考手册

细节

生物浏览 差异性,,,,kegg,,,,多重组合,,,,网络,,,,NetworkEnrichment,,,,途径,,,,软件
版本 1.20.0
在生物导体中 Bioc 2.12(R-3.0)(5。5年)
执照 GPL-3
要看 R(> = 1.14.0)
进口
链接
建议 Pathnetdata,,,,运行,,,,生物基因
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 pathnet_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 PATHNET_1.20.0.ZIP
Mac OS X 10.11(El Capitan) pathnet_1.20.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pathnet
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/pathnet
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/pathnet/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题: