RIPSeeker

DOI:10.18129 / B9.bioc.RIPSeeker

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见RIPSeeker．

RIPSeeker:用于从RIP-seq实验中识别蛋白质相关转录本的统计包

Bioconductor版本:3.7

利用负二项发射概率的两态HMM从RIP-seq对准中推断和区分RIP峰值。虽然RIPSeeker是专门为RIP-seq数据分析量身定制的，但它还提供了一套生物信息学工具，集成在这个独立的软件包中，全面解决了从对齐后处理到可视化和注释等问题。

作者:李越

维护者:Yue Li

安装

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文档

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PDF	R脚本	RIPSeeker:用于从RIP-seq实验中识别蛋白质相关转录本的统计包
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文本		新闻

细节

biocViews	RIPSeq，测序，软件
版本	1.20.0
在Bioconductor	BioC 2.12 (R-3.0)(5.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R(>= 2.15)，方法，S4Vectors(> = 0.9.25),IRanges，GenomicRanges，SummarizedExperiment，Rsamtools，GenomicAlignments，rtracklayer
进口
链接
建议	biomaRt，ChIPpeakAnno平行,GenomicFeatures
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.cs.utoronto.ca/~yueli/software.html
全靠我	RIPSeekerData
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	RIPSeeker_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	RIPSeeker_1.20.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	RIPSeeker_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RIPSeeker
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RIPSeeker
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/RIPSeeker/
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