Ruvseq

doi:10.18129/b9.bioc.ruvseq

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅Ruvseq

从RNA-Seq数据中删除不需要的变化

生物导体版本:3.7

该软件包实现了Risso等人的删除不需要的变化(RUV)方法。(2014)用于在样品之间进行RNA-Seq读数的归一化。

作者:Davide Risso [AUT,CRE,CPH],Sandrine Dudoit [aut],Lorena Pantano [CTB],Kamil Slowikowski [CTB]

维护者:davide risso

引用(从r内,输入引用(“ ruvseq”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ ruvseq”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ ruvseq”)

PDF R脚本 RUVSEQ:从RNA-Seq数据中删除不需要的变化
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 差异性,,,,预处理,,,,rnaseq,,,,软件
版本 1.14.0
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(4年)
执照 艺术2.0
要看 生物酶,,,,EDASEQ(> = 1.99.1),EDGER
进口 方法,大量的
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rcolorbrewer,,,,斑马鱼,,,,deseq2
系统要求
增强
URL https://github.com/drisso/ruvseq
BugReports https://github.com/drisso/ruvseq/issues
取决于我 rnaseqgene
进口我 烤饼
建议我 DESCAN2
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 ruvseq_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 ruvseq_1.14.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) ruvseq_1.14.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ruvseq
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/ruvseq
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/ruvseq/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户