暹罗

doi：10.18129/b9.bioc.siamcat

该包适用于生物导体的3.7版；对于稳定的最新版本，请参阅暹罗。

微生物群落与宿主表型之间关联的统计推断

生物导体版本：3.7

微生物群落与宿主表型（暹罗）之间关联的统计推断的管道。分析微生物组数据的主要目标是确定与环境因素相关的社区组成的变化。特别是，将人类微生物组组成与宿主表型（如疾病）联系起来已成为强烈研究的领域。为此，至关重要的是鲁棒的统计建模和生物标志物提取工具包。暹罗提供了一条完整的管道支持数据预处理，统计关联测试，统计建模（LASSO逻辑回归），包括用于评估和解释这些模型的工具（例如交叉验证，参数选择，ROC分析和诊断模型图）。

作者：Georg Zeller [aut]（），Konrad Zych [aut，cre，cre]0516>），jakob Wirbel [aut]（），Morgan Essex [CTB]，Nicolai Karcher [CTB]，Kersten Breuer [CTB [CTB] [CTB]

维护者：konrad zych

安装

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文档

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html	R脚本	暹罗
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	分类，，，，聚类，，，，特征提取，，，，遗传因素，，，，宏基因组学，，，，微生物组，，，，多重组合，，，，预处理，，，，回归，，，，测序，，，，软件
版本	1.0.0
执照	GPL-3
要看	r（> = 3.5.0），MLR，，，，门索
进口	beanplot，，，，Glmnet，图形，grdevices，网格，Gridbase，，，，栅格，，，，liblinear，，，，矩阵， 方法，Paramhelpers，，，，Proc，，，，prroc，，，，rcolorbrewer，统计，utils
链接
建议	生物使用，，，，Optparse，，，，测试，，，，尼特，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

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源包	siamcat_1.0.0.0.tar.gz
Windows二进制	siamcat_1.0.0.0.zip
Mac OS X 10.11（El Capitan）	siamcat_1.0.0.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/siamcat
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/siamcat
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/siamcat/
软件包下载报告	下载统计