Singlecellexperiment

doi:10.18129/b9.bioc.singlecellexperiment

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅Singlecellexperiment

单元数据的S4类

生物导体版本:3.7

定义用于从单细胞实验存储数据的S4类。这包括用于存储和检索每个细胞的峰值信息的专门方法,降低降低坐标和尺寸因子以及基因和库的通常元数据。

作者:Aaron Lun [AUT,CPH],Davide Risso [AUT,CRE,CPH],Keegan Korthauer [CTB]

维护者:davide risso

引用(从r内,输入引用(“ Singlecellexperiment”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持url(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ singlecelecelellexperiment”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Singlecellexperiment”)

html R脚本 Singlecellexperiment课程的介绍
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 DataImport,,,,datarepresentation,,,,基础设施,,,,Singlecell,,,,软件
版本 1.2.0
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.5),总结性特征
进口 S4VECTORS, 方法,生物基因,UTILS
链接
建议 测试,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,scrnaseq,,,,马格里特,,,,RTSNE
系统要求
增强
URL
取决于我 基本,,,,簇发酵,,,,液滴,,,,我明白,,,,桅杆,,,,评分,,,,scpipe,,,,斯克兰,,,,Simplesinglecell,,,,Singlecelltk,,,,飞溅,,,,switchde,,,,tenxbraindata,,,,Zinbwave
进口我 BEARSCC,,,,ccfindr,,,,谱系,,,,NetSmooth,,,,SC3,,,,SCDD,,,,scfind,,,,scmap,,,,scnorm,,,,激流回旋
建议我 desingle,,,,命运,,,,苯酚,,,,scfeaturefilter
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 singlecellexperiment_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 singlecellexperiment_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) singlecellexperiment_1.2.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/singlecellexperiment
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/singlecellexperiment
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/singlecellexperiment/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户