TCGAbiolinksGUI

DOI:10.18129 / B9.bioc.TCGAbiolinksGUI

这个包是3.7版本的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见TCGAbiolinksGUI。

TCGAbiolinksGUI:一个分析癌症分子和临床数据的图形用户界面

Bioconductor版本:3.7

TCGAbiolinksGUI:一个分析癌症分子和临床数据的图形用户界面。GUI的演示版本可以在https://tcgabiolinksgui.shinyapps.io/tcgabiolinks/找到。

作者:Tiago Chedraoui Silva ， Antonio Colaprico < Antonio。Colaprico在ulb。ac。请听卡特琳娜·奥尔森(catherine Olsen)的报道。b>， Michele Ceccarelli, Gianluca Bontempi在ulb.ac。本杰明·p·伯曼<本杰明。伯曼在cshs.org>， Houtan Noushmehr

维护者:Tiago C. Silva

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("TCGAbiolinksGUI")

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文本		新闻

细节

biocViews	DNAMethylation，DNASeq，DifferentialExpression，DifferentialMethylation，GUI，GeneExpression，GeneRegulation，遗传学，MethylationArray，网络，通路，测序，软件，StatisticalMethod
版本	1.6.1
在Bioconductor中	BioC 3.5 (R-3.4)(1.5年)
许可证	GPL (>= 3)
取决于	R (>= 3.3.1)，shinydashboard(> = 0.5.3),TCGAbiolinksGUI.data
进口	闪亮的(> = 0.14.1),下载器(>= 0.4)，网格，DT，情节，readr，maftools，stringr(> = 1.1.0版),SummarizedExperiment，ggrepel，data.table，minfi，脱字符号，IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19，IlluminaHumanMethylation450kmanifest，IlluminaHumanMethylation27kmanifest，IlluminaHumanMethylation27kanno.ilmn12.hg19，IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b2.hg19，IlluminaHumanMethylationEPICmanifest，shinyFiles(> = 0.6.2),ggplot2(> =魅惑,pathview，埃尔默(> = 2.0.0),clusterProfiler平行,TCGAbiolinks(> = 2.5.5),shinyjs(> = 0.7),colourpicker，shinyBS(> = 0.61)
链接
建议	testthat，dplyr，knitr，roxygen2，devtools，房车，xml2，BiocStyle，动画，老鸨
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

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源包	TCGAbiolinksGUI_1.6.1.tar.gz
Windows二进制	TCGAbiolinksGUI_1.6.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	TCGAbiolinksGUI_1.6.1.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/TCGAbiolinksGUI
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/TCGAbiolinksGUI
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/TCGAbiolinksGUI/
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