此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见TFutils.
Bioconductor版本:3.7
包来处理TF数据。
作者:Vincent Carey [aut], Shweta Gopaulakrishnan [cre, aut]
维护者:Shweta Gopaulakrishnan
引文(从R内,输入引用(“TFutils”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“TFutils”)
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browseVignettes(“TFutils”)
超文本标记语言 | R脚本 | TFutils——表示TFBS和TF目标集 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 软件,转录组 |
版本 | 1.0.0 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.5.0) |
进口 | 方法,GenomicRanges,IRanges,S4Vectors,GSEABase,闪亮的,miniUI,data.table,dplyr,magrittr,AnnotationDbi,Rsamtools,GenomeInfoDb,GenomicFiles,AnnotationFilter,GenomicFeatures,Gviz, utils,统计,Biobase |
链接 | |
建议 | knitr,DT,Homo.sapiens,GO.db,org.Hs.eg.db,ensembldb,EnsDb.Hsapiens.v75,testthat,BiocParallel,BiocStyle,SummarizedExperiment,UpSetR,ggplot2 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | TFutils_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | TFutils_1.0.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | TFutils_1.0.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TFutils |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TFutils |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/TFutils/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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