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TarSeqQC
DOI:10.18129 / B9.bioc.TarSeqQC
这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅TarSeqQC。
有针对性的测序实验质量控制
Bioconductor版本:3.7
包允许表示r .这是基于目前的有针对性的实验方案和合并功能做一个质量控制这类实验和测序的快速勘探地区。生成一个xlsx文件作为输出。
作者:加芙美利奴,克里斯托瓦尔弗雷斯诺,Yanina Murua,安德里亚Llera和埃尔默费尔南德斯
维护人员:加芙美利奴<美利奴。在gmail.com gabriela33 >
从内部引用(R,回车引用(“TarSeqQC”)):
安装
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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“TarSeqQC”)
文档
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| R脚本 | TarSeqQC:有针对性的测序实验质量控制 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 对齐,报道,DataImport,质量控制,测序,软件,TargetedResequencing,可视化 |
| 版本 | 1.10.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.2 (r - 3.2)(3年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R(> = 3.4.1)、方法GenomicRanges,Rsamtools(> = 1.20.4),ggplot2,plyr,openxlsx |
| 进口 | 统计,grDevices跑龙套,S4Vectors,IRanges,BiocGenerics,reshape2,GenomeInfoDb,BiocParallel,Biostrings,cowplot、图形、GenomicAlignments,Hmisc |
| 链接 | |
| 建议 | RUnit |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://www.bdmg.com.ar |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | TarSeqQC_1.10.0.tar.gz |
| Windows二进制 | TarSeqQC_1.10.0.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | TarSeqQC_1.10.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TarSeqQC |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TarSeqQC |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/TarSeqQC/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
