arrayQualityMetrics

DOI:10.18129 / B9.bioc.arrayQualityMetrics

这个包是3.7版本的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见arrayQualityMetrics。

微阵列数据集的质量指标报告

Bioconductor版本:3.7

该软件包为Bioconductor微阵列数据容器(ExpressionSet, NChannelSet, AffyBatch)中的数据生成微阵列质量指标报告。支持一个和两个颜色阵列平台。

作者:Audrey Kauffmann, Wolfgang Huber

维护者:Mike Smith < Mike。史密斯在英国

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("arrayQualityMetrics")

文档

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browseVignettes(“arrayQualityMetrics”)

PDF	R脚本	高级主题:自定义arrayQualityMetrics报告和输出的程序化处理
PDF	R脚本	介绍:微阵列质量评估与arrayQualityMetrics
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	微阵列，OneChannel，质量控制，ReportWriting，软件，TwoChannel
版本	3.36.0
在Bioconductor中	BioC 2.1 (R-2.6)(11岁)
许可证	LGPL (>= 2)
取决于
进口	affy，affyPLM(> = 1.27.3),beadarray，Biobase，开罗(> = 1.4 6),genefilter、图形、grDevices、网格、gridSVG(> = 1.4 3),Hmisc，hwriter，晶格，latticeExtra，limma、方法、RColorBrewer，setRNG，统计，utils，vsn(> = 3.23.3),XML
链接
建议	ALLMLL，亚兰，BiocStyle，knitr
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/grimbough/arrayQualityMetrics/issues
这取决于我
进口我	天哪
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	arrayQualityMetrics_3.36.0.tar.gz
Windows二进制	arrayQualityMetrics_3.36.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	arrayQualityMetrics_3.36.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/arrayQualityMetrics
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/arrayQualityMetrics
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/arrayQualityMetrics/
软件包下载报告	下载数据