Blima

doi:10.18129/b9.bioc.blima

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅Blima

用于对探测器(珠)水平的Illumina微阵列进行预处理和分析的工具

生物导体版本:3.7

软件包Blima包括几种用于预处理Illumina微阵列数据的算法。它集中在珠级分析上,并为不等长度的向量的分位归一化提供了新的方法。它提供了多种背景校正方法,包括背景减法,RMA(例如卷积和背景离群)的去除。它还在珠子水平上实现方差稳定转换。也有实施的数据摘要方法。它还提供了在检测器(珠)水平上执行t检验的方法以及用于差异表达测试的探针水平。

作者:vojtěchkulvait

维护者:vojtěchkulvait

引用(从r内,输入引用(“ Blima”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ blima”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Blima”)

PDF R脚本 Blima.pdf
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 差异性,,,,基因表达,,,,结肠管制,,,,微阵列,,,,正常化,,,,预处理,,,,软件
版本 1.14.0
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(4年)
执照 GPL-3
要看 R(> = 3.3)
进口 Beadarray(> = 2.0.0),生物酶(> = 2.0.0),RCPP(> = 0.12.8),生物基因,grdevices,统计,图形
链接 RCPP
建议 Xtable,,,,blimatestingdata,,,,生物使用,,,,Illuminahumanv4.db,,,,Lumi,,,,尼特
系统要求
增强
URL https://bitbucket.org/kulvait/blima
取决于我
进口我
建议我 blimatestingdata
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Blima_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 blima_1.14.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) Blima_1.14.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/blima
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/blima
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/blima/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户