cellbaseR

DOI:10.18129 / B9.bioc.cellbaseR

这个包是3.7版本的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见cellbaseR。

从高性能Cellbase web查询标注数据

Bioconductor版本:3.7

这个R包使用了详尽的RESTful Web服务API，该API已经为Cellabase数据库实现。它使研究人员能够从单个数据库中查询和获取丰富的生物信息，节省了大量的时间。另一个好处是，研究人员可以很容易地查询不同的生物学主题，并将所有这些信息链接在一起，因为所有信息都是集成的。

作者:Mohammed OE Abdallah

维护者:Mohammed OE Abdallah

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("cellbaseR")

文档

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browseVignettes(“cellbaseR”)

超文本标记语言	R脚本	简化基因组注释
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释，软件，VariantAnnotation
版本	1.4.0
在Bioconductor中	BioC 3.5 (R-3.4)(1.5年)
许可证	Apache License (== 2.0)
取决于	R (>= 3.4)
进口	方法,jsonlite，httr，data.table，pbapply，tidyr，R.utils，Rsamtools，BiocParallel，foreach， utils, parallel;doParallel
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，Gviz，VariantAnnotation
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/melsiddieg/cellbaseR
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	cellbaseR_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	cellbaseR_1.4.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	cellbaseR_1.4.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/cellbaseR
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/cellbaseR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/cellbaseR/
软件包下载报告	下载数据