该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅克洛诺特犬。
生物导体版本:3.7
T细胞抗原受体序列的高通量分析编码T细胞受体的基因是通过体细胞重组产生的,从而产生了V,(D)和J段的巨大组合。重组期间的其他过程在V和J段之间创造了额外的序列多样性。总体而言,此超变量区域称为CDR3环。该软件包的目的是从多个序列文库中处理和定量分析数百万个称为clonotypes的V-CDR3-J组合。
作者:Charles Plessy
维护者:Charles Plessy
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html | R脚本 | Clonotyper用户指南 |
参考手册 | ||
文本 | 读书我 | |
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 测序,,,,软件 |
版本 | 1.18.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.13(R-3.0)(5年) |
执照 | 文件许可证 |
要看 | |
进口 | 方法 |
链接 | |
建议 | 生物基因,,,,EDGER,,,,尼特,,,,PVCLUST,,,,运行,,,,素食主义者 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | http://clonotyper.branchable.com/ |
BugReports | http://clonotyper.branchable.com/bugs/ |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | clonotyper_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | clonotyper_1.18.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | clonotyper_1.18.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/clonotyper |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/clonotyper |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/clonotyper/ |
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