contiBAIT

DOI:10.18129 / B9.bioc.contiBAIT

此包适用于Bioconductor的3.7版本;有关稳定的最新发布版本，请参见contiBAIT．

利用Strand-Seq数据改进早期构建基因组组装

Bioconductor版本:3.7

利用来自生物体的多个单细胞的链遗传数据，contiBAIT可以将未连接的contigs聚在一起，形成假定的染色体，并将这些染色体中的contigs排序。

作者:基兰·奥尼尔，马克·希尔斯，迈克·戈特利布

维护者:Kieran O'Neill

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite(" contbait ")

文档

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browseVignettes(“contiBAIT”)

PDF	R脚本	flowBi
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	CellBasedAssays，遗传学，GenomeAssembly，质量控制，软件，WholeGenome
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.3 (R-3.3)(2.5年)
许可证	BSD_2_clause +文件LICENSE
取决于	黑洞(> = 1.51.0-3),Rsamtools(> = 1.21)
进口	data.tablegrDevices,线索，集群，gplots，IRanges，GenomicRanges，S4Vectors，Rcpp，茶匙，GenomicFiles，gtools，rtracklayer，BiocParallel，DNAcopy，色彩，reshape2，ggplot2、方法、exomeCopy，GenomicAlignments，图
链接	Rcpp，黑洞
建议	BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	contiBAIT_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	contiBAIT_1.8.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	contiBAIT_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/contiBAIT
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ contiBAIT
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/contiBAIT/
包下载报告	下载数据