crlmm

这个包是3.7版本的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见crlmm。

Affymetrix SNP 5.0和6.0和Illumina阵列的基因型调用(CRLMM)和拷贝数分析工具

Bioconductor版本:3.7

更快地实现特定于SNP 5.0和6.0阵列的CRLMM，以及特定于5.0,6.0和Illumina平台的拷贝数工具。

作者:Benilton S Carvalho, Robert Scharpf, Matt Ritchie, Ingo Ruczinski, Rafael A Irizarry

维护者:Benilton S Carvalho < Benilton在unicamp。br>， Robert Scharpf ， Matt Ritchie < Ritchie at wehi.EDU.AU>

引用(来自R，输入引用(“crlmm”)）：

要安装这个包，启动R并输入:

##如果https:// url不支持，尝试http:// ("//www.andersvercelli.com/biocLite.R")

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browseVignettes(“crlmm”)

PDF		拷贝数估计
PDF		crlmm小插图-下游分析
PDF	R脚本	基因分型
PDF		用于拷贝数分析的基础结构
PDF		副本编号插图概述
PDF		用于拷贝数分析的Illumina阵列预处理和基因分型
PDF		参考手册
文本		新闻

biocViews	CopyNumberVariation，微阵列，预处理，单核苷酸多态性，软件
版本	1.38.0
在Bioconductor中	BioC 2.4 (R-2.9)(9.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 2.14.0)，oligoClasses(> = 1.21.12),preprocessCore(> = 1.17.7)
进口	方法,Biobase(> = 2.15.4),BiocGenerics，affyio(> = 1.23.2),illuminaio，椭圆，mvtnorm，样条曲线，统计，SNPchip跑龙套,晶格，ff，foreach，RcppEigen(> = 0.3.1.2.1),matrixStats，VGAM，平行，图形，limma，beanplot
链接	preprocessCore(> = 1.17.7)
建议	hapmapsnp6，genomewidesnp6Crlmm(> = 1.0.7),GGdata，snpStats，RUnit
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我	VanillaICE
建议我	ArrayTV，hapmap370k，oligoClasses，SNPchip
链接到我
构建报告

遵循2021年欧洲杯比分预测在您的R会话中使用此包的说明。

源包	crlmm_1.38.0.tar.gz
Windows二进制	crlmm_1.38.0.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	crlmm_1.38.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/crlmm
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/crlmm
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/crlmm/
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