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decontam
DOI:10.18129 / B9.bioc.decontam
这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅decontam。
识别标志基因中的污染物和宏基因组测序数据
Bioconductor版本:3.7
简单的统计识别污染标志基因序列特征或宏基因组数据。适用于任何类型的特性来源于环境测序数据(例如asv、辣子鸡、分类群的杂志,…)。需要DNA定量数据或测序负控制样本。
作者:< benjamin.j本杰明·卡拉汉。卡拉汉在gmail.com >,Nicole Marie Davis
维修工:本杰明·卡拉汉< benjamin.j。卡拉汉在gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“decontam”)):
安装
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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“decontam”)
文档
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| HTML | R脚本 | 介绍dada2 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 分类,宏基因组,微生物组,测序,软件 |
| 版本 | 1.0.0 |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R(> = 3.4.1)、方法(> = 3.4.1) |
| 进口 | ggplot2(> =魅惑,reshape2(> = 1.4.1),统计数据 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,phyloseq |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/benjjneb/decontam |
| BugReports | https://github.com/benjjneb/decontam/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | decontam_1.0.0.tar.gz |
| Windows二进制 | decontam_1.0.0.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | decontam_1.0.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/decontam |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ decontam |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/decontam/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
