doppelgangR

DOI:10.18129 / B9.bioc.doppelgangR

这个包是3.7版本的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见doppelgangR．

从基因组或元数据中识别可能的重复样本

Bioconductor版本:3.7

主要函数是doppelgangR()，它将ExpressionSet对象的列表作为最小输入，并搜索所有列表对以查找重复的样本。搜索基于基因组数据(exps (esset))，表型/临床数据(pData(esset))和“确凿证据”- pData(esset)中发现的所谓唯一标识符。

作者:Levi Waldron, Markus Riester, Marcel Ramos

维护者:Levi Waldron

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持来源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("doppelgangR")

文档

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超文本标记语言	R脚本	doppelgangR装饰图案
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文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，微阵列，质量控制，RNASeq，软件
版本	1.8.0
在Bioconductor中	BioC 3.3 (R-3.3)(2.5年)
许可证	GPL (> = 2.0)
取决于	R (>= 3.3)，Biobase，BiocParallel
进口	股东价值分析，嫁祸于，消化，mnormt、方法、grDevices、图形、统计、utils
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，curatedOvarianData，ROCR，pROC，RUnit，simulatorZ，代理
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/lwaldron/doppelgangR
BugReports	https://github.com/lwaldron/doppelgangR/issues
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	doppelgangR_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	doppelgangR_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	doppelgangR_1.8.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/doppelgangR
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/doppelgangR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/doppelgangR/
软件包下载报告	下载数据