flowWorkspace

DOI:10.18129 / B9.bioc.flowWorkspace

这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅flowWorkspace。

基础设施与封闭的交互为代表和血细胞计数

Bioconductor版本:3.7

这个包是为了方便比较自动控制方法与手工浇注在flowJo完成。这个包让你基本flowJo工作区导入BioConductor和复制flowJo使用flowCore功能的控制。控制层次结构,样品组、补偿和转换,以便执行输出匹配flowJo分析。

作者:迈克格雷格•Finak江

维修工:格雷格Finak < gfinak fhcrc.org >,迈克江< wjiang2 fhcrc.org >

安装

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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“flowWorkspace”)

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HTML	R脚本	flowWorkspace简介:一个包来存储和maninpulate封闭的流数据
HTML	R脚本	如何合并GatingSets
HTML	R脚本	如何绘制的数据
PDF		参考手册
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文本		安装

细节

biocViews	DataImport,DataRepresentation,FlowCytometry,预处理,软件
版本	3.28.2
Bioconductor自	BioC 2.9 (r - 2.14)(7年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.16.0),flowCore(> = 1.45.14),ncdfFlow(> = 2.25.4)
进口	Biobase,BiocGenerics,图、图形、grDevices晶格、方法、统计stats4跑龙套,RBGL,XML、工具、gridExtra,Rgraphviz,data.table,dplyr,latticeExtra,Rcpp,RColorBrewer,stringr,尺度,flowViz,matrixStats
链接	Rcpp,黑洞(> = 1.62.0-1),RProtoBufLib,cytolib(> = 1.1.3)
建议	testthat,flowWorkspaceData,knitr,ggcyto、并行
SystemRequirements	xml2, GNU C + + 11
增强了
URL
取决于我	flowStats,ggcyto,openCyto,限定符
进口我	CytoML,flowDensity,openCyto,限定符
建议我	指南针,flowClust,flowCore
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	flowWorkspace_3.28.2.tar.gz
Windows二进制	flowWorkspace_3.28.2.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	flowWorkspace_3.28.2.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowWorkspace
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ flowWorkspace
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/flowWorkspace/
包下载报告	下载数据