Genextender
doi：10.18129/b9.bioc.genextender
该包适用于生物导体的3.7版；对于稳定的最新版本，请参阅Genextender。
CHIP-SEQ数据的优化功能注释
生物导体版本：3.7
Genextender使用快速迭代峰坐标/GTF比对算法优化芯片序列的功能注释。由于不同的CHIP-SEQ峰呼叫者产生不同的差异富集峰，峰值长度分布和总峰值计数的差异很大，因此带有其最接近基因的注释峰列表可能是一个嘈杂的过程。因此，Genextender的目的是将差异富集的峰与各自的基因稳健地联系起来，从而有助于实验性随访和验证QPCR期间一组潜在基因候选物的引物。
作者：Bohdan Khomtchouk [AUT，CRE]
维护者：bohdan khomtchouk
引用（从r内，输入引用（“ Genextender”））：
安装
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文档
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| R脚本 | Genextender Vignette | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 注解，，，，chipseq，，，，芯片奇普，，，，覆盖范围，，，，DataImport，，，，差异词，，，，去，，，，遗传学，，，，基因数，，，，历史化，，，，NaturallanguageProcessing，，，，峰值探测，，，，软件，，，，可视化 |
| 版本 | 1.6.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.4（R-3.3）（2年） |
| 执照 | GPL（> = 3） |
| 要看 | go.db，，，，org.rn.eg.db，，，，rtracklayer，r（> = 3.3.1） |
| 进口 | AnnotationDbi，，，，Data.Table，，，，dplyr，图形，NetworkD3，，，，org.ag.eg.db，，，，org.bt.eg.db，，，，org.ce.eg.db，，，，org.cf.eg.db，，，，org.dm.eg.db，，，，org.dr.eg.db，，，，org.gg.eg.db，，，，org.hs.eg.db，，，，org.mm.eg.db，，，，org.mmu.eg.db，，，，org.pt.eg.db，，，，org.sc.sgd.db，，，，org.ss.eg.db，，，，org.xl.eg.db，，，，rcolorbrewer，，，，雪球，，，，Tm值，utils，WordCloud |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/bohdan-khomtchouk/genextender |
| BugReports | https://github.com/bohdan-khomtchouk/genextender/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | genextender_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | genextender_1.6.0.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | genextender_1.6.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genextender |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/genextender |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/genextender/ |
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