geneplast

DOI:10.18129 / B9.bioc.geneplast

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见geneplast

同源群的进化和可塑性分析

Bioconductor版本:3.7

基因质体是为进化和可塑性分析而设计的,基于给定物种树中同源群的分布。利用香农信息论和正交丰度来估计进化可塑性指数。此外,它实现了桥梁算法,以确定一个给定的基因的进化根基于其正交分布。

作者:Rodrigo Dalmolin, Mauro Castro

维护者:Mauro Castro < Mauro .a.。卡斯特罗在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“geneplast”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“geneplast”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“geneplast”)

超文本标记语言 R脚本 基因质体:进化生根和可塑性分析。
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GeneRegulation遗传学软件SystemsBiology
版本 1.6.2
在Bioconductor BioC 3.4 (R-3.3)(2年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R(>= 3.3),方法
进口 igraph, grDevices,图形,统计,utils
链接
建议 研制RUnitBiocGenericsBiocStyleknitrrmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 geneplast_1.6.2.tar.gz
Windows二进制 geneplast_1.6.2.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) geneplast_1.6.2.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/geneplast
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/geneplast
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/geneplast/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一: