此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见kissDE.
Bioconductor版本:3.7
检索RNA-seq数据中特定条件的变体(snv,替代剪接,indels)。它被开发为“KisSplice”的后处理,但也可以用于用户自己的数据。
作者:Clara Benoit-Pilven [aut], Camille Marchet [aut], Janice Kielbassa [aut], Lilia Brinza [aut], Audric Cologne [aut], Aurélie Siberchicot [aut, cre], Vincent Lacroix [aut], Frank Picard [ctb], Laurent Jacob [ctb], Vincent Miele [ctb]
维护者:Aurélie Siberchicot
引文(从R内,输入引用(“kissDE”)
):
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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“kissDE”)
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browseVignettes(“kissDE”)
R脚本 | kissDE.pdf | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | AlternativeSplicing,DifferentialSplicing,ExperimentalDesign,GenomicVariation,RNASeq,软件,转录组 |
版本 | 1.0.0 |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | |
进口 | 大气气溶胶,Biobase,DESeq2,DSS,ggplot2,glmnet,gplots,图形,grDevices,matrixStats,R.utils,统计,效用 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | kissDE_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | kissDE_1.0.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | kissDE_1.0.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/kissDE |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/kissDE |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/kissDE/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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