metaseqr

doi:10.18129/b9.bioc.metaseqr

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅metaseqr

通过组合多种统计算法,用于分析RNA-SEQ数据的R软件包。

生物导体版本:3.7

为RNA-Seq基因表达数据提供了几个归一化和统计测试包的接口。此外,它创建了几个诊断图,通过结合几个统计测试的结果并以交互式方式报告结果,从而执行荟萃分析。

作者:panagiotis moulos

维护者:panagiotis moulos

引用(从r内,输入引用(“ metaseqr”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ metaseqr”)

文档

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PDF R脚本 使用MetaseQR的Mulitple统计算法的RNA-Seq数据分析
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 差异性,,,,基因表达,,,,正常化,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,报告写作,,,,软件,,,,工作流程
版本 1.20.0
在生物导体中 Bioc 2.14(R-3.1)(4。5年)
执照 GPL(> = 3)
要看 r(> = 2.13.0),EDASEQ,,,,deseq,,,,林玛,,,,QVALUE
进口 EDGER,,,,Noingsq,,,,贝塞克,,,,NBPSEQ,,,,Biomart,utils,GPLOTS,,,,Corrplot,,,,VSN,,,,酿造,,,,rjson,,,,log4r
链接
建议 生物基因,,,,基因组机,,,,rtracklayer,,,,rsamtools,,,,survomp,,,,Venndiagram,,,,尼特,,,,动物园,,,,运行,,,,Biocinstaller,,,,BSGENOME,,,,rsqlite
系统要求
增强 平行,TCC,,,,rmysql
URL http://www.fleming.gr
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 metaseqr_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 METASEQR_1.20.0.ZIP
Mac OS X 10.11(El Capitan) metaseqr_1.20.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metaseqr
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/metaseqr
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/metaseqr/
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