此包适用于Bioconductor的3.7版本;有关稳定的最新发布版本,请参见methylInheritance.
Bioconductor版本:3.7
基于蒙特卡罗抽样的排列分析,用于验证以下假设:几代之间保守差异甲基化元素的数量与从一种处理继承的效应有关,而该随机效应可以被排除。
作者:Astrid Deschênes, Pascal Belleau和Arnaud Droit
维护人员:Astrid Deschenes
引用(从R中,输入引用(“methylInheritance”)
):
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##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite(" methyllinheritance ")
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browseVignettes(“methylInheritance”)
超文本标记语言 | R脚本 | 基于置换的分析将保守的差异甲基化元素从一代关联到下一代的处理效果 |
参考手册 | ||
文本 | 自述 | |
文本 | 新闻 |
biocViews | BiologicalQuestion,DNAMethylation,DifferentialMethylation,表观遗传学,MethylSeq,测序,软件,StatisticalMethod,WholeGenome |
版本 | 1.4.0 |
在Bioconductor公司 | BioC 3.5 (R-3.4)(1.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.4) |
进口 | methylKit,BiocParallel,GenomicRanges,IRanges,S4Vectors方法,并行,ggplot2,gridExtra,字谜 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,BiocGenerics,knitr,rmarkdown,RUnit,methInheritSim |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/adeschen/methylInheritance |
BugReports | https://github.com/adeschen/methylInheritance/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | methInheritSim |
给我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | methylInheritance_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | methylInheritance_1.4.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | methylInheritance_1.4.0.tgz |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/methylInheritance |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ methyllinheritance |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/methylInheritance/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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