此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见ndexr.
Bioconductor版本:3.7
这个包提供了一个到NDEx服务器的接口,例如http://ndexbio.org/的公共服务器。它可以通过API检索和保存网络。网络以RCX对象和图图表示形式提供。
作者:Frank Kramer < Frank . Kramer at med. ini - goettgen .de>, Florian Auer < Florian。auer at med.uni- goettgen .de>, Alex Ishkin
维护者:Florian Auer < Florian。Auer在med.uni- goettgen .de>
引文(从R内,输入引用(“ndexr”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“ndexr”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“ndexr”)
超文本标记语言 | R脚本 | NDExR装饰图案 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,网络,通路,软件 |
版本 | 1.2.0 |
许可证 | BSD |
取决于 | igraph |
进口 | httr,jsonlite,plyr,tidyr |
链接 | |
建议 | BiocStyle,testthat,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/frankkramer-lab/ndexr |
BugReports | https://github.com/frankkramer-lab/ndexr/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | ndexr_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | ndexr_1.2.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | ndexr_1.2.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ndexr |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ndexr |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/ndexr/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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