oppar

DOI:10.18129 / B9.bioc.oppar

这个包是3.7版本的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见oppar。

R的异常值分布和通路分析

Bioconductor版本:3.7

Wang et al.(2012)发表的mCOPA包的R实现。Oppar提供了癌症异常值分析方法。虽然最初是为了检测癌症研究中的异常基因而开发的，但oppar中提出的方法通常可用于异常谱分析。此外，还提供了基因集富集和途径分析的工具。

作者:Chenwei王(aut) Alperen Taciroglu (aut),斯蒂芬·R Maetschke (aut),科琳C纳尔逊(aut),马克Ragan (aut),梅丽莎·戴维斯(aut) Soroor Hediyeh陈守煜,(cre) Momeneh Foroutan (ctr)

维护人员:Soroor Hediyeh zadeh

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("oppar")

文档

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browseVignettes(“oppar”)

超文本标记语言	R脚本	OPPAR: R的异常值分布和通路分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，GeneSetEnrichment，通路，软件，SystemsBiology
版本	1.8.0
在Bioconductor中	BioC 3.3 (R-3.3)(2.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.3)
进口	Biobase、方法、GSEABase，GSVA
链接
建议	knitr，rmarkdown，limma，org.Hs.eg.db，GO.db，雪、并行
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	oppar_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	oppar_1.8.0.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	oppar_1.8.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/oppar
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/oppar
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/oppar/
软件包下载报告	下载数据