Paxtoolsr
doi：10.18129/b9.bioc.paxtoolsr
该包适用于生物导体的3.7版；对于稳定的最新版本，请参阅Paxtoolsr。
PAXTOOLSR：从多个数据库到Biopax和Pathway Commons的访问路径
生物导体版本：3.7
该软件包提供了一组R函数，用于使用PAXTools与Biopax OWL文件进行交互，并查询路径CONSON（PC）分子交互数据库，该数据库由Memorial Sloan-Kettering Cancer Center（MSKCC）的计算生物学中心托管。途径Commons数据库包括：结合，Biogrid，Corum，CTD，DIP，药物库，HPRD，Humancyc，完整，kegg，Mirtarbase，Panther，Panther，Phosphospedplus，Reactome，Reactome，Recon，Recon，TransFac。
作者：奥古斯丁·卢娜（Augustin Luna）
维护者：Augustin Luna
引用（从r内，输入引用（“ paxtoolsr”））：
安装
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##尝试http：//如果不支持https：// url不支持源（“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”）bioclite（“ paxtoolsr”）
文档
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| html | R脚本 | 使用paxtoolsr |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 基因烯，，，，GraphandNetwork，，，，kegg，，，，网络，，，，NetworkEnrichment，，，，途径，，，，Reactome，，，，软件，，，，系统生物学 |
| 版本 | 1.14.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.0（R-3.1）（4年） |
| 执照 | LGPL-3 |
| 要看 | r（> = 3.2），rjava（> = 0.9-8），XML |
| 进口 | httr，，，，Igraph，，，，plyr，，，，rjson，，，，r.utils，，，，Data.Table，，，，jsonlite |
| 链接 | |
| 建议 | 测试，，，，尼特，，，，生物使用，，，，rmarkDown，，，，rcolorbrewer，，，，Biomart，，，，雌激素，，，，副词，，，，HGU95AV2，，，，HGU95AV2CDF，，，，林玛，，，，foreach，，，，Dosnow， 平行，org.hs.eg.db |
| 系统要求 | Java（> = 1.6） |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/biopax/paxtoolsr |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | paxtoolsr_1.14.0.tar.gz |
| Windows二进制 | paxtoolsr_1.14.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | paxtoolsr_1.14.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/paxtoolsr |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/paxtoolsr |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/paxtoolsr/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
