rgsepd

DOI:10.18129 / B9.bioc.rgsepd

这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅rgsepd

基因集富集/投影显示

Bioconductor版本:3.7

R / GSEPD是一个生物信息学计划来帮助消除歧义转录组样本(一个矩阵RNA-Seq计数RefSeq IDs)通过自动化微分表达式(DESeq2),然后基因集富集(GOSeq),最后一个n维投影量化方法每个样本就像治疗组。

作者:Stamm卡尔

Stamm维护者:卡尔<卡尔。stamm gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“rgsepd”)):

安装

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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“rgsepd”)

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PDF R脚本 介绍rgsepd包
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpression,GeneSetEnrichment,RNASeq,软件
版本 1.12.0
Bioconductor自 BioC 3.1 (r - 3.2)(3.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 3.5.0),DESeq2,goseq(> = 1.28)
进口 gplots,biomaRt,org.Hs.eg.db,GO.db,SummarizedExperiment,哈希,AnnotationDbi
链接
建议 引导、工具、BiocGenerics,knitr,xtable
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包 rgsepd_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 rgsepd_1.12.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) rgsepd_1.12.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rgsepd
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rgsepd
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/rgsepd/
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