samExploreR

DOI:10.18129 / B9.bioc.samExploreR

这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅samExploreR。

samExploreR包:高性能阅读综述计算向量的avaliability测序深度还原模拟

Bioconductor版本:3.7

这个R包是专为二次抽样过程模拟与降低测序深度测序实验。这个包可以用来anlayze数据来自所有主要的测序平台如Illumina公司GA, HiSeq, MiSeq,罗氏GS-FLX, ABI固体和LifeTech离子的PGM质子测序。它支持多个操作系统incluidng Linux、Mac OS X、FreeBSD和Solaris。与使用Rsubread发达。

作者:Alexey Stupnikov, Shailesh Tripathi和弗兰克Emmert-Streib

维护人员:shailesh tripathi < shailesh。tripathy gmail.com >

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PDF	R脚本	samExploreR装饰图案
PDF		参考手册

细节

biocViews	对齐,ChIPSeq,DNASeq,GeneExpression,GeneRegulation,GeneTarget,GeneticVariability,GenomeAnnotation,预处理,RNASeq,SequenceMatching,测序,软件,WholeGenome
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于	ggplot2,Rsubread,RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14,刨边机R (> = 3.4.0)
进口	grDevices、统计图形
链接
建议	BiocStyle,RUnit,BiocGenerics,矩阵
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	samExploreR_1.4.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	samExploreR_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/samExploreR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ samExploreR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/samExploreR/
包下载报告	下载数据