此包适用于Bioconductor的3.7版本;有关稳定的最新发布版本,请参见sangerseqR.
Bioconductor版本:3.7
这个包包含几个用于分析R中的桑格测序数据文件的工具,包括读取.scf和.ab1文件,进行基本调用和绘制色谱图。
作者:jonathan T. Hill, Bradley Demarest
维护者:Jonathon Hill
引用(从R中,输入引用(“sangerseqR”)
):
要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("sangerseqR")
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“sangerseqR”)
R脚本 | sangerseqR | |
参考手册 |
biocViews | 单核苷酸多态性,测序,软件,可视化 |
版本 | 1.16.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.14 (R-3.1)(4.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (> = 3.0.2),Biostrings |
进口 | 方法,闪亮的 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,RUnit,BiocGenerics |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | CrispRVariants |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | sangerseqR_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | sangerseqR_1.16.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | sangerseqR_1.16.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sangerseqR |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ sangerseqR |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/sangerseqR/ |
包下载报告 | 下载数据 |
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