sangerseqR

DOI:10.18129 / B9.bioc.sangerseqR

此包适用于Bioconductor的3.7版本;有关稳定的最新发布版本,请参见sangerseqR

R中Sanger测序数据的工具

Bioconductor版本:3.7

这个包包含几个用于分析R中的桑格测序数据文件的工具,包括读取.scf和.ab1文件,进行基本调用和绘制色谱图。

作者:jonathan T. Hill, Bradley Demarest

维护者:Jonathon Hill

引用(从R中,输入引用(“sangerseqR”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("sangerseqR")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“sangerseqR”)

PDF R脚本 sangerseqR
PDF 参考手册

细节

biocViews 单核苷酸多态性测序软件可视化
版本 1.16.0
Bioconductor自 BioC 2.14 (R-3.1)(4.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (> = 3.0.2),Biostrings
进口 方法,闪亮的
链接
建议 BiocStyleknitrRUnitBiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我 CrispRVariants
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 sangerseqR_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 sangerseqR_1.16.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) sangerseqR_1.16.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sangerseqR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ sangerseqR
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/sangerseqR/
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