snpStats

DOI:10.18129 / B9.bioc.snpStats

此包适用于Bioconductor的3.7版本;有关稳定的最新发布版本，请参见snpStats．

SnpMatrix和XSnpMatrix类和方法

Bioconductor版本:3.7

大型SNP关联研究的类和统计方法。这扩展了早期的snpMatrix包，允许基因型的不确定性。

作者:David Clayton

维护者:David Clayton

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("snpStats")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“snpStats”)

PDF	R脚本	数据输入
PDF	R脚本	置
PDF	R脚本	归责和元分析
PDF	R脚本	LD统计
PDF	R脚本	主成分分析
PDF		snpMatrix-differences
PDF	R脚本	snpStats介绍
PDF	R脚本	TDT)测试
PDF		参考手册

细节

biocViews	GeneticVariability，微阵列，单核苷酸多态性，软件
版本	1.30.0
在Bioconductor公司	BioC 2.8 (R-2.13)(7.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 2.10.0)，生存，矩阵、方法
进口	图形，grDevices, stats, utils，BiocGenerics，zlibbioc
链接
建议	hexbin
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	eQTL，GGBase，GGdata
进口我	FunciSNP，GeneGeneInteR，GGtools，gQTLstats，gwascat，ldblock，马提尼，餐，旅游房车，scoreInvHap
建议我	crlmm，GWASTools，omicRexposome，omicsPrint，VariantAnnotation
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	snpStats_1.30.0.tar.gz
Windows二进制	snpStats_1.30.0.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	snpStats_1.30.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/snpStats
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/snpStats
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/snpStats/
软件包下载报告	下载数据