这个包是3.7版本的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本,请参见飞溅.
Bioconductor版本:3.7
飞溅是一个包模拟单细胞RNA测序计数数据。它提供了一个简单的接口,用于创建可重复且文档完备的复杂模拟。可以从实际数据中估计参数,并提供用于比较真实数据集和模拟数据集的函数。
作者:Luke Zappia
维护者:卢克·扎皮亚<卢克。Zappia在mci .edu.au b>
引用(来自R,输入引用(“飞溅”)
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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“飞溅”)
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browseVignettes(“飞溅”)
超文本标记语言 | R脚本 | 对飞溅包的介绍 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | GeneExpression,RNASeq,测序,SingleCell,软件,转录组 |
版本 | 3 |
在Bioconductor中 | BioC 3.5 (R-3.4)(1.5年) |
许可证 | GPL-3 +文件LICENSE |
取决于 | R (>= 3.4),SingleCellExperiment |
进口 | akima,BiocGenerics,BiocParallel,使彻底失败,刨边机,fitdistrplus,ggplot2,locfit,matrixStats、方法、尺度,嘘(>= 1.7.4), stats,SummarizedExperiment跑龙套,蜡笔 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,covr,cowplot,knitr,limSolve,lme4,进步,pscl,testthat,rmarkdown,S4Vectors,scDD,食物,mfa,phenopath,基础知识,zinbwave,SparseDC |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/Oshlack/splatter |
BugReports | https://github.com/Oshlack/splatter/issues |
这取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | SummarizedBenchmark |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。
源包 | splatter_1.4.3.tar.gz |
Windows二进制 | splatter_1.4.3.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | splatter_1.4.3.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/splatter |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ spl飞溅 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/splatter/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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