飞溅

DOI:10.18129 / B9.bioc.splatter

这个包是3.7版本的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本,请参见飞溅

单细胞RNA测序数据的简单模拟

Bioconductor版本:3.7

飞溅是一个包模拟单细胞RNA测序计数数据。它提供了一个简单的接口,用于创建可重复且文档完备的复杂模拟。可以从实际数据中估计参数,并提供用于比较真实数据集和模拟数据集的函数。

作者:Luke Zappia

维护者:卢克·扎皮亚<卢克。Zappia在mci .edu.au b>

引用(来自R,输入引用(“飞溅”)):

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“飞溅”)

文档

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browseVignettes(“飞溅”)

超文本标记语言 R脚本 对飞溅包的介绍
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews GeneExpressionRNASeq测序SingleCell软件转录组
版本 3
在Bioconductor中 BioC 3.5 (R-3.4)(1.5年)
许可证 GPL-3 +文件LICENSE
取决于 R (>= 3.4),SingleCellExperiment
进口 akimaBiocGenericsBiocParallel使彻底失败刨边机fitdistrplusggplot2locfitmatrixStats、方法、尺度(>= 1.7.4), stats,SummarizedExperiment跑龙套,蜡笔
链接
建议 BiocStylecovrcowplotknitrlimSolvelme4进步pscltestthatrmarkdownS4VectorsscDD食物mfaphenopath基础知识zinbwaveSparseDC
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/Oshlack/splatter
BugReports https://github.com/Oshlack/splatter/issues
这取决于我
进口我
建议我 SummarizedBenchmark
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包 splatter_1.4.3.tar.gz
Windows二进制 splatter_1.4.3.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) splatter_1.4.3.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/splatter
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ spl飞溅
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/splatter/
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