该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅Zinbwave。
生物导体版本:3.7
实现通用且灵活的零膨胀的负二项模型,该模型可用于提供单细胞RNA-seq数据的低维表示。该模型解释了零通货膨胀(辍学),过度分散和数据的计数性质。该模型还解释了库大小的差异以及批处理效果和/或其他协变量的差异,从而避免了对数据进行预伸缩的需求。
作者:Davide Risso [AUT,CRE,CPH],Svetlana Gribkova [AUT],Fanny Perraudeau [aut],Jean-Philippe Vert [aut]
维护者:davide risso
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html | R脚本 | Zinbwave Vignette |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 维度,,,,基因表达,,,,rnaseq,,,,测序,,,,Singlecell,,,,软件,,,,转录组学 |
版本 | 1.2.0 |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | R(> = 3.4),方法,总结性特征,,,,Singlecellexperiment |
进口 | 系词,,,,Glmnet,,,,生物比较,,,,软增生,统计GeneFilter,,,,EDGER |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,矩阵,,,,马格里特,,,,scrnaseq,,,,GGPLOT2,,,,Biomart,,,,生物使用,,,,RTSNE,,,,deseq2,,,,Seurat |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/drisso/zinbwave/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | 飞溅 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Zinbwave_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | zinbwave_1.2.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | zinbwave_1.2.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/zinbwave |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/zinbwave |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/zinbwave/ |
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