rnaSeqMap的代码。Rnw“# # #编码:utf - 8 ################################################### ### 代码块1号:camelRegions (eval = FALSE ) ################################################### ## rs < - newSeqReads (ch、圣恩,str);## rs <- getBamData(rs,idx.)同时,心血管疾病(cvd) # # nd < getCoverageFromRS (rs, idx.both ) ################################################### ### 代码块2号:camel1 (eval = FALSE ) ################################################### ## idxT <——(样本条件= =“T”美元)# # idxC <——(样本条件美元= = " C ") ################################################### ### 代码块3号:camel2 (eval = FALSE ) ################################################### ## 地区。gR < - rnaSeqMap::: .fiveCol2GRanges (tmp ) ################################################### ### 代码块数量4:camel3 (eval = FALSE ) ################################################### ## regionsCamelMeasures < gRanges2CamelMeasures (regions.gR、样品、idxT idxC,金额=总结,进步= 10 ) ################################################### ### 代码块5号:camel4 (eval = FALSE ) ################################################### ## idx <——(regionsCamelMeasures(,“covDensC1”)> 10 | regionsCamelMeasures(,“covDensC1”)> 10)# # regionsCamelMeasures < - regionsCamelMeasures [idx , ] ################################################### ### 代码块6号:camel5 (eval = FALSE ) ################################################### ## o < -订单(QQ regionsCamelMeasures[。”毫米”,减少= T) # # regionsCamelMeasures < - regionsCamelMeasures [o , ] ################################################### ### 代码块7号:Lindell (eval = FALSE ) ################################################### ## 钕。AL <- finregionsasnd (nd, 15, minsup=5)