这个包是3.7版本的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本,请参见BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.masked。
Bioconductor版本:3.7
智人(人类)全基因组序列由UCSC提供(hg38, december 2013),并存储在Biostrings对象中。序列与BSgenome.Hsapiens.UCSC相同。hg38,除了它们的顶部有以下4个掩码:(1)组装间隙掩码(AGAPS掩码),(2)连续歧义掩码(AMB掩码),(3)来自RepeatMasker的重复掩码(RM掩码),(4)来自Tandem repeats Finder的重复掩码(TRF掩码)。缺省情况下,只有AGAPS和AMB掩码处于活动状态。
作者:Bioconductor开发团队
维护者:Bioconductor Package维护者< maintainer@bioconductor.org >
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):
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参考手册 |
biocViews | AnnotationData,BSgenome,遗传学,Homo_sapiens |
版本 | 1.3.99 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | BSgenome(> = 1.35.17),BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38 |
进口 | BSgenome,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38 |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
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这取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | BSgenome,podkat |
链接到我 |
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源包 | BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.masked_1.3.99.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.masked/ |
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