BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.masked

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.masked

这个包是3.7版本的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本,请参见BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.masked

智人全掩膜基因组序列(UCSC版本hg38)

Bioconductor版本:3.7

智人(人类)全基因组序列由UCSC提供(hg38, december 2013),并存储在Biostrings对象中。序列与BSgenome.Hsapiens.UCSC相同。hg38,除了它们的顶部有以下4个掩码:(1)组装间隙掩码(AGAPS掩码),(2)连续歧义掩码(AMB掩码),(3)来自RepeatMasker的重复掩码(RM掩码),(4)来自Tandem repeats Finder的重复掩码(TRF掩码)。缺省情况下,只有AGAPS和AMB掩码处于活动状态。

作者:Bioconductor开发团队

维护者:Bioconductor Package维护者< maintainer@bioconductor.org >

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细节

biocViews AnnotationDataBSgenome遗传学Homo_sapiens
版本 1.3.99
许可证 艺术- 2.0
取决于 BSgenome(> = 1.35.17),BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38
进口 BSgenomeBSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38
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源包 BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.masked_1.3.99.tar.gz
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