RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14

DOI:10.18129 / B9.bioc.RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14

这个包是3.7版本的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14。

来自RNAseq实验的对齐reads:通过HNRNPC敲低和控制HeLa细胞的高通量测序进行转录分析

Bioconductor版本:3.7

该包包含8个BAM文件，每个测序运行1个。每个BAM文件通过(1)使用TopHat2将读取(配对端)与hg19全基因组比对，然后(2)亚子集以仅保留chr14上的比对获得。有关实验的详细信息，请参阅ArrayExpress数据库的登录号E-MTAB-1147，包括已发表研究(由Zarnack等人，2012)和FASTQ文件的链接。

作者:hervevev pag

维护者:hervevev pag

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##如果https:// url不支持，试试http:// ("//www.andersvercelli.com/biocLite.R")

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	ArrayExpress，ExperimentData，地理，基因组，Homo_sapiens_Data，NCI，RNASeqData，SequencingData
版本	0.18.0
许可证	LGPL
取决于
进口
链接
建议	GenomicAlignments，BiocInstaller
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-MTAB-1147/
这取决于我	samExploreR，测序
进口我
建议我	BiocParallel，GenomicAlignments，GenomicFiles，GenomicRanges，咆哮，Rsamtools，SplicingGraphs
链接到我
构建报告

包档案

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源包	RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14_0.18.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14/
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