该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅rforpoteomics。
生物导体版本:3.7
该软件包包含代码,以说明使用R和Bioconductor手稿对蛋白质组学数据分析进行蛋白质组学数据分析的“使用R和Bioconductor”和“可视化”。小插图描述了复制论文中描述的示例和数字所需的代码和数据以及蛋白质组学可视化的功能。它还包含各种功能,以发现用于质谱和蛋白质组学的R软件。
作者:Laurent Gatto [AUT,CRE],Thomas Lin Pedersen [CTB],Sebastian Gibb [CTB],Vlad Petyuk [CTB]
维护者:laurent Gatto
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html | R脚本 | 使用R和生物导体可视化蛋白质组学数据 |
html | R脚本 | 使用R和生物导体可视化蛋白质组学数据 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 实验数据,,,,群众光谱,,,,reproducibleresearch |
版本 | 1.18.1 |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | MSNBase(> = 2.5.3) |
进口 | r.utils,,,,生物酶,,,,rpx,,,,生物浏览,,,,Biocinstaller,,,,InteractiveSplay,,,,DT,,,,AnnotationDbi,,,,闪亮的 |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用,,,,MZR,,,,XCMS,,,,MSDATA,,,,isobar,,,,害怕(> = 1.12),马尔德方外,,,,readbrukerflexdata,,,,rtandem,,,,突触,,,,SynapterData,,,,ippd,,,,rdisop,,,,orgmassspecr,,,,总结性特征,,,,脑,,,,洛尔,,,,HPAR,,,,go.db,,,,org.hs.eg.db,,,,E1071,,,,Biomart,,,,rcolorbrewer,,,,GGPLOT2,,,,RESHAPE2,,,,Xtable,,,,格子,,,,mzid,,,,proloc,,,,prolocdata,,,,msgfplus,,,,MSGFGUI,,,,MSNID,,,,msmstests,,,,MSMSEDA,,,,dep,,,,Corrplot,,,,beanplot,,,,热倍,,,,GPLOTS,,,,Venndiagram,,,,PROTVIZ,,,,GeneFilter |
系统要求 | |
增强 | 切肉刀 |
URL | http://lgatto.github.com/rforproteomics/ |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | MSSTATSQC,,,,proteoqc,,,,QCMetrics |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | rforpoteomics_1.18.1.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rforproteomics |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/rforpoteomics |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/rforproteomics/ |
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