systemPipeRdata

DOI:10.18129 / B9.bioc.systemPipeRdata

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见systemPipeRdata．

systemPipeRdata: NGS工作流模板和示例数据

Bioconductor版本:3.7

systemPipeRdata是一个帮助包，它用一个命令生成NGS工作流模板，供其父包systemPipeR使用。后者是为下一代序列(NGS)应用程序(如RNA-Seq、RIBO-Seq、ChIP-Seq、VAR-Seq和许多其他应用程序)构建端到端分析管道的环境。systemPipeR的概述部分给出了使用systemPipeRdata的详细示例。

作者:Thomas Girke

维护者:Thomas Girke < Thomas。Girke在ucr.edu>

安装

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文档

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超文本标记语言	R脚本	概述装饰图案
PDF		参考手册
文本		自述
文本		新闻

细节

biocViews	对齐，ChIPSeq，报道，DataImport，ExperimentData，GeneExpression，GeneSetEnrichment，遗传学，基础设施，MethylSeq，质量控制，RNASeq，单核苷酸多态性，测序
版本	1.8.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法
进口	BiocGenerics
链接
建议	RUnit，BiocStyle，knitr，rmarkdown，systemPipeR
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/tgirke/systemPipeRdata
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	systemPipeRdata_1.8.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/systemPipeRdata
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/systemPipeRdata
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/systemPipeRdata/
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