工作流包:RNAseq123

使用limma, Glimma和edgeR, RNA-seq分析像1-2-3一样简单

Bioconductor版本:3.7

R包，支持f1000研究工作流文章，使用limma, Glimma和edgeR由Law等人(2016)进行RNA-seq分析。

作者:《慈善法》，Monther Alhamdoosh, Shian Su, Gordon Smyth和Matthew Ritchie

维护者:Matthew Ritchie

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“RNAseq123”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的可用工作流，启动R并输入:

browseVignettes(“RNAseq123”)

超文本标记语言

R脚本

使用limma, Glimma和edgeR, RNA-seq分析像1-2-3一样简单

细节

biocViews	GeneExpressionWorkflow，工作流
版本	1.2.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.3.0)，Glimma(> = 1.1.9),limma，刨边机，Mus.musculus
进口
链接
建议	knitr，rmarkdown，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	http://f1000research.com/articles/5-1408/
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