工作流程包：rnaseqgeneedgerql
基因级RNA-SEQ差异表达和途径分析使用RSUBREAD和EDGER准型管道
生物导体版本：3.7
通过其Vignette，该工作流程包提供了使用RSUBREAD和EDGER软件包对RNA-Seq实验进行完整的案例研究分析。工作流程从读取对齐开始，一直持续到数据探索，到差异表达，最后是途径分析。该分析包括出版质量图，GO和KEGG分析，以及对先前实验产生的表达签名的分析。
作者：Yunshun Chen，Aaron Lun，Gordon Smyth
维护者：yunshun chen
引用（从r内，输入引用（“ rnaseqgeneedgerql”））：
安装
要安装此软件包，请启动R并输入：
##尝试http：//如果不支持https：// url不支持源（“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”）bioclite（“ rnaseqgeneedgerql”）
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的可用工作流，请启动R并输入：
browsevignettes（“ rnaseqgeneedgerql”）
| html | R脚本 | 从读取到基因再到途径：使用RSUBREAD和EDGER QUASI-LIKELIOHION PIPELINE对RNA-SEQ实验的差异表达分析 |
细节
| 生物浏览 | geneexpressionworkflow，，，，工作流程 |
| 版本 | 1.2.3 |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | r（> = 3.3.0），EDGER，，，，GPLOTS，，，，org.mm.eg.db，，，，go.db |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，编织 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | http://f1000research.com/articles/5-1438 |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
