工作流包:eQTL

使用Bioconductor GGtools 5.x进行云支持的顺式eqtl搜索

Bioconductor版本:3.7

该工作流程的重点是在cis中搜索eQTL，以便检测表达基因的局部DNA变异是否存在关联。

作者:文森特·凯里[作家，作家]

维护者:文森特·凯里(Vincent Carey)

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("eQTL")

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的可用工作流，启动R并输入:

browseVignettes(“eQTL”)

超文本标记语言

R脚本

使用Bioconductor GGtools 5.x进行云支持的顺式eqtl搜索

细节

biocViews	GenomicVariantsWorkflow，工作流
版本	1.2.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.3.0)，GGdata，GGtools，GenomeInfoDb，S4Vectors，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37，助理，biglm，data.table，doParallel，foreach，knitcitations，光民，lumiHumanAll.db平行,rmeta，scatterplot3d，snpStats、网格yri1kgv
进口
链接
建议	knitr，rmarkdown，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	//www.andersvercelli.com/help/workflows/eQTL/
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