Bioconductor版本:3.7
liftOver设施结合UCSC的浏览器开发的轨道基础设施可供农庄格式的数据转换。这是说明一个图像的EBI / NHGRI GWAS目录,截至2017年5月10日,分布式的坐标定义为NCBI hg38建造。
作者:Bioconductor包维护者(aut (cre)
维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >
从内部引用(R,回车引用(“liftOver”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“liftOver”)
查看可用工作流这个包的版本安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“liftOver”)
HTML | R脚本 | 改变基因组与rtracklayer坐标系统::liftOver |
biocViews | BasicWorkflow,工作流 |
版本 | 1.2.0 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 3.3.0),gwascat,GenomicRanges,rtracklayer,Homo.sapiens,BiocGenerics |
进口 | |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | //www.andersvercelli.com/help/workflows/liftOver/ |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |