该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅分配。
生物导体版本:3.8
分配是一种计算工具,用于评估单个患者样本中的途径放松管制/激活状态。分配采用灵活的贝叶斯因子分析方法,该方法适应了从知识文献或从扰动实验到细胞/组织特异性途径标志的预定途径标志。每个上下文特异性途径的放松管制/激活水平被量化为分数,这表示患者样品包含途径放松管制/激活签名的程度。
作者:Ying Shen,Andrea H. Bild,W。EvanJohnson和Mumtehena Rahman
维护者:ying shen
引用(从r内,输入引用(“分配”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“分配”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“分配”)
html | R脚本 | 底漆 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 贝叶斯,,,,基因表达,,,,途径,,,,软件 |
版本 | 1.18.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.14(R-3.1)(5年) |
执照 | 麻省理工学院 +文件许可证 |
要看 | R(> = 3.4) |
进口 | GPLOTS,图形,grdevices,MSM,,,,rlab,统计SVA,utils,GGPLOT2,,,,Yaml |
链接 | |
建议 | 测试,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://compbiomed.github.io/assign/ |
BugReports | https://github.com/compbiomed/assign/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | tays_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | 分配_1.18.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | 分配_1.18.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/assign |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/分配 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/assign/ |
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