分配

doi:10.18129/b9.bioc.Assign

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅分配

自适应签名选择和集成(分配)

生物导体版本:3.8

分配是一种计算工具,用于评估单个患者样本中的途径放松管制/激活状态。分配采用灵活的贝叶斯因子分析方法,该方法适应了从知识文献或从扰动实验到细胞/组织特异性途径标志的预定途径标志。每个上下文特异性途径的放松管制/激活水平被量化为分数,这表示患者样品包含途径放松管制/激活签名的程度。

作者:Ying Shen,Andrea H. Bild,W。EvanJohnson和Mumtehena Rahman

维护者:ying shen ,W。EvanJohnson ,David Jenkins ,mumtehena rahman >

引用(从r内,输入引用(“分配”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“分配”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“分配”)

html R脚本 底漆
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 贝叶斯,,,,基因表达,,,,途径,,,,软件
版本 1.18.0
在生物导体中 Bioc 2.14(R-3.1)(5年)
执照 麻省理工学院 +文件许可证
要看 R(> = 3.4)
进口 GPLOTS,图形,grdevices,MSM,,,,rlab,统计SVA,utils,GGPLOT2,,,,Yaml
链接
建议 测试,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL https://compbiomed.github.io/assign/
BugReports https://github.com/compbiomed/assign/issues
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 tays_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 分配_1.18.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) 分配_1.18.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/assign
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/分配
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/assign/
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