buscrect

doi：10.18129/b9.bioc.buscorrect

该包适用于生物导体的3.8版；对于稳定的最新版本，请参阅buscrect。

批处理效应校正以未知子类型

生物导体版本：3.8

高通量实验数据在公共数据库中呈指数积累。但是，从这些丰富的资源中挖掘有效的科学发现受到技术文物和固有的生物异质性的阻碍。前者通常被称为“批处理效应”，后者通常以“亚型”为模型。R套件BUSCRECT拟合贝叶斯分层模型，即批处理校正 - 未知式套件模型（BUS），以在存在未知子类型的情况下纠正批处理效应。总线能够（a）明确纠正批处理效应，（b）将具有相似特性的样品分组到亚型中，（c）识别区分亚型的特征，以及（d）享受线性阶级计算复杂性。

作者：xiangyu luo

维护者：xiangyu luo

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.5”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ buscorrect”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ buscorrect”）

PDF	R脚本	BUSCORRECT_USER_GUIDE
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	批处理效应，，，，贝叶斯，，，，聚类，，，，特征提取，，，，基因表达，，，，软件，，，，统计信息
版本	1.0.0
在生物导体中	Bioc 3.8（R-3.5）（0.5岁）
执照	GPL（> = 2）
要看	R（> = 3.5.0）
进口	GPLOTS，方法，grdevices，统计，总结性特征
链接
建议	生物使用，，，，尼特，，，，运行，，，，生物基因
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	buscorrect_1.0.0.0.tar.gz
Windows二进制	buscorrect_1.0.0.0.zip（32-和64位）
Mac OS X 10.11（El Capitan）	buscorrect_1.0.0.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/buscorrect
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：套餐/buscorrect
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/buscorrect/
软件包下载报告	下载统计