该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅比法特。
生物导体版本:3.8
BIFET确定了TFS在纠正目标区域和背景区域之间的读数和GC内容不平衡引起的偏差之后,与背景区域相比,目标区域中的足迹在目标区域相比具有过高的代表性。对于给定的TF K,BIFET检验了零假设,即目标区具有相同的概率,即在校正读数计数和GC含量偏置的同时对TF K作为背景区域具有足迹。为此,我们将带有TF K,T_K足迹的目标区域数量用作测试统计量,并将P值计算为观察T_K或更多目标区域的概率,并在零假设下使用足迹。
作者:Ahrim Youn [AUT,CRE],Eladio Marquez [AUT],Nathan Lawlor [AUT],Michael Stitzel [aut],Duygu Ucar [aut]
维护者:ahrim Youn
引用(从r内,输入引用(“ Bifet”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ bifet”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
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Browsevignettes(“ Bifet”)
html | R脚本 | 使用Bifet的指南 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | Atacseq,,,,DNASESEQ,,,,表观遗传学,,,,结肠管制,,,,遗传学,,,,免疫学,,,,Ripseq,,,,软件,,,,转录 |
版本 | 1.2.1 |
在生物导体中 | Bioc 3.7(R-3.5)(1年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | |
进口 | 统计,Poibin,,,,基因组机 |
链接 | |
建议 | 测试,,,,尼特 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | bifet_1.2.1.tar.gz |
Windows二进制 | bifet_1.2.1.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | bifet_1.2.1.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bifet |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/bifet |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/bifet/ |
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