BiocStyle

DOI:10.18129 / B9.bioc.BiocStyle

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见BiocStyle．

小插图和其他Bioconductor文档的标准样式

Bioconductor版本:3.8

为Bioconductor PDF和HTML文档提供标准格式样式。欧洲杯2021体育彩票包小插图说明使用和功能。

作者:安德烈·奥莱乌奇、马丁·摩根、沃尔夫冈·胡贝尔

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

安装

要安装这个包，启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“BiocStyle”)

超文本标记语言	R脚本	创作R Markdown小插图
PDF	R脚本	生物导体乳胶风格2.0
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	软件
版本	2.10.0
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(5.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于
进口	bookdown，knitr(> = 1.12),rmarkdown(>= 1.2)， stats, utils，yaml，BiocManager
链接
建议	BiocGenerics，RUnit，htmltools
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/Bioconductor/BiocStyle
BugReports	https://github.com/Bioconductor/BiocStyle/issues
全靠我	chipseqDB，curatedBreastData，methylationArrayAnalysis，rnaseqGene，simpleSingleCell
进口我	abseqR，ASpli，BiocWorkflowTools，BPRMeth，BubbleTree，chimeraviz，指南针，cytofWorkflow，geneXtendeR，PathoStat，regionReport，Rmmquant，Rqc，srnadiff
建议我	ABAData，ABAEnrichment，王牌，适应，AffiXcan，affycoretools，AHEnsDbs，AllelicImbalance，allenpvc，AMOUNTAIN，amplican，AneuFinder，注释，AnnotationDbi，AnnotationFilter，AnnotationForge，AnnotationHub，AnnotationHubData，annotatr，anota2seq，arrayQualityMetrics，数组，artMS，ASGSCA，亚瑟士，ASICSdata，AssessORF，AssessORFData，分配，ATACseqQC，AUCell，BaalChIP，培根，bamsignals，basecallQC，基础知识，BayesPeak，bayNorm，baySeq，beachmat，beadarray，BeadDataPackR，BEARscc，BgeeDB，bigmelon，bigmemoryExtras，bioassayR，bioCancer，BiocFileCache，BiocMetaWorkflow，BiocNeighbors，BiocOncoTK，BioCor，BiocParallel，BiocPkgTools，biomaRt，biomformat，biosigner，biotmle，BitSeq，blima，blimaTestingData，BloodCancerMultiOmics2017，bnbc，分歧点，breakpointR，breakpointRdata，BridgeDbR，BrowserViz，bsseq，BUMHMM，BUScorrect，咖啡馆，CAGEfightR，篮球选手，CAMTHC，CancerInSilico，萤石，红衣主教，CardinalWorkflows，催化剂，cbaf，ccfindR，ccrepe，cellbaseR，cellity，CellMapper，CellMapperData，cellTree，CexoR，ChemmineDrugs，ChemmineOB，ChemmineR，芝加哥，ChIPComp，chipenrich，chipenrich.data，ChIPexoQual，ChIPpeakAnno，ChIPQC，ChIPseeker，ChIPSeqSpike，chromstaR，chromswitch，ClassifyR，cleanUpdTSeq，切肉刀，限幅器，CLLmethylation，clusterExperiment，clusterSeq，ClusterSignificance，cn，CNPBayes，可可，CoGAPS，彗星，compcodeR，condcomp，承认，consensusSeekeR，contiBAIT，conumee，CopyhelpeR，CopyNeutralIMA，文案，警戒线，CoRegNet，COSMIC.67，cosmiq，CountClust，covRNA，cpvSNP，CRISPRseek，CrispRVariants，CTDquerier，ctsGE，curatedBladderData，curatedCRCData，curatedMetagenomicData，curatedOvarianData，curatedTCGAData，CVE，cydar，dada2，dagLogo，DaMiRseq，DAPAR，DChIPRep，ddPCRclust，decontam，反编排，DEGreport，DelayedArray，DelayedMatrixStats，部，DEqMS，derfinder，derfinderHelper，derfinderPlot，DEScan2，DEXSeq，DiffBind，diffcyt，diffuStats，不和谐的，DmelSGI，dmrseq，DNABarcodes，doppelgangR，Doscheda，剂量，drawProteins，DRIMSeq，DropletUtils，dSimer，DSS，DuoClustering2018，dupRadar，easyRNASeq，EBImage，EDASeq，EGSEA，EGSEA123，eiR，埃尔默，ELMER.data，EmpiricalBrownsMethod，EnrichmentBrowser，ensembldb，EpiDISH，epivizr，epivizrChart，epivizrData，epivizrServer，epivizrStandalone，eQTL，erma，ERSSA，EuPathDB，EventPointer，ExperimentHub，ExperimentHubData，ExpressionNormalizationWorkflow，FamAgg，FastqCleaner，fCCAC，fCI，小伙子，FindMyFriends，flowcatchR，flowMap，FlowSOM，fmcsR，FourCSeq，furrowSeg，GA4GHclient，GA4GHshiny，空对空导弹，gcapc，GDSArray，genbankr，GeneAccord，genefilter，GeneOverlap，geneplast，generegulation，GeneStructureTools，GenoGAM，GenomeInfoDb，GenomicAlignments，GenomicDataCommons，GenomicFeatures，GenomicFiles，GenomicInteractions，GenomicRanges，GenomicScores，GenomicTuples，genoset，GenVisR，GeuvadisTranscriptExpr，ggbio，Glimma，glmSparseNet，GMRP，GOexpress，GOfuncR，GoogleGenomics，还装有，goSTAG，gpart软件，gQTLBase，gQTLstats，石墨，GreyListChIP，GRmetrics，groHMM，GSAR，GSE62944，GSEABase，GSEABenchmarkeR，GUIDEseq，Gviz，gwasurvivr，哈曼，HarmanData，HD2013SGI，HDCytoData，HDF5Array，HelloRanges，HelloRangesData，highthroughputassays，Hiiragi2013，hipathia，HIREewas，HiTC，HMP16SData，HPAanalyze，hpAnnot，hpar，HTSFilter，HumanAffyData，理想的，iGC，igvR，IHW，IHWpaper，illuminaio，imageHTS，ima，Imetagene，immunoClust，InPAS，检查，InTAD，InteractionSet，InterMineR，电离，IRanges，iSEE，isomiRs，iva，JctSeqData，JunctionSeq，karyoploteR，kissDE，liftOver，Linnorm，loci2path，Logolas，萝拉，LoomExperiment，LowMACA，lpsymphony，LRBaseDbi，M3D，MACPET，maEndToEnd，MAGeCKFlute，mAPKL，微波激射器，桅杆，MatrixRider，事，MaxContrastProjection，工商管理硕士，mbt，MCbiclust，mCSEA，mCSEAdata，mdgsa，餐，MEDIPS，墨西拿，MetaboSignal，metagene，metagenomeFeatures，metavizr，methimpute，methInheritSim，MethPed，MethylAid，MethylAidData，methylInheritance，MethylMix，methyvim，methyvimData，MetNet，mfa，微生物组，mimager，minfi，minionSummaryData，米拉，miRcomp，miRmine，miRSM，miRsponge，missMethyl，missRows，mixOmics，mlm4omics，MLSeq，MMDiff2，这种款式，mogsa，MoonlightR，motifbreakR，motifStack，mpra，mQTL。核磁共振，MSMB，MSnbase，MSnID，msPurity，msqc1，MSstats，MSstatsBioData，MSstatsTMT，MTseeker，MultiAssayExperiment，MultiDataSet，multiHiCcompare，multiMiR，MutationalPatterns，MWASTools，mygene，myvariant，mzR，NADfinder，NanoStringDiff，NanoStringQCPro，NarrowPeaks，ndexr，netbiov，nethet，netprioR，netReg，netSmooth，nondetects，normr，npGSEA，nucleoSim，诊断，益生元，omicade4，omicRexposome，OmicsMarkeR，omicsPrint，奥纳西斯，OnassisJavaLibs，OncoScore，OncoSimulR，ontoProc，OPWeight，ORFik，Organism.dplyr，Oscope，先驱者，PAA，PANTHER.db，PanVizGenerator，parathyroidSE，pasilla，PasillaTranscriptExpr，Path2PPI，paxtoolsr，Pbase，pcaExplorer，PCAN，PCHiCdata，PepsNMR，PepsNMRData，perturbatr，PGA，PGPC，phantasus，phenopath，philr，phyloseq，π，Pigengene，plethy，plotGrouper，plyranges，Polyfit，powerTCR，pqsfinder，profileScoreDist，pRoloc，pRolocGUI，适当的，Prostar，蛋白质组学，ProteomicsAnnotationHubData，ProteoMM，proteoQC，PSEA，PureCN，PWMEnrich，qcmetrics，QDNAseq，qpgraph，qsea，QSutils，quantro，QuasR，R3CPET，RaggedExperiment，雨，ramwas，RandomWalkRestartMH，Rbowtie，Rcade，rcellminer，rcellminerData，rCGH，RcisTarget，RCy3，RCyjs，rDGIdb，ReactomePA，重新计票，recountWorkflow，收回，红色的，RefNet，地区，regsplice，ReQON，restfulSE，rexposome，RforProteomics，rfPred，RGMQL，RGMQLlib，RGraph2js，RGSEA，rhdf5，rhdf5client，Rhdf5lib，Rhtslib，RiboProfiling，riboSeqR，河，RJMCMCNucleosomes，RNAprobR，RNAseq123，rnaseqcomp，RnaSeqSampleSize，RnaSeqSampleSizeData，Rnits，的方式，ropls，rpx，rqt，Rsamtools，RTCGAToolbox，研制，RTNduals，RTNsurvival，RUVcorr，RUVSeq，旅游房车，rWikiPathways，S4Vectors，samExploreR，sampleClassifier，sampleClassifierData，sangerseqR，sapFinder，嘘，scDD，SCLCBam，SCnorm，司康饼，scoreInvHap，食物，scRNAseq，颈背，segmentSeq，seqCAT，seqPattern，seqplots，seqsetvis，SeqSQC，测序，SeqVarTools，sevenC，SGSeq，shinyMethyl，ShortRead，SIAMCAT，SigCheck，SigFuge，印，SIMD，similaRpeak，SIMLR，simulatorZ，sincell，Single.mTEC.Transcriptomes，SingleCellExperiment，singleCellTK，紧身的，SNPediaR，SNPhood，SNPhoodData，soGGi，sparseDOSSA，sparsenetgls，SparseSignatures，specL，SpidermiR，飞溅，分裂，SSPA，经验丰富的人，斯坦，StarBioTrek，STATegRa，statTarget，strandCheckR，SummarizedBenchmark，SummarizedExperiment，股东价值分析，SVAPLSseq，swfdr，switchde，synapter，systemPipeR，systemPipeRdata，TabulaMurisData，TargetSearch，TCGAbiolinks，TCGAbiolinksGUI，TCGAbiolinksGUI.data，TCGAutils，TENxBrainData，TENxPBMCData，TFARM，TFBSTools，TFHAZ，TFutils，tigre，TimerQuant，tissueTreg，TMixClust，ToPASeq，topdownr，泛太平洋伙伴关系，tracktables，trackViewer，transcriptogramer，transcriptR，tra利用，时尚的，tRNA，tRNAdbImport，tRNAscanImport，TRONCO，TTMap，TurboNorm，TVTB，twoddpcr，universalmotif，variancePartition，VariantAnnotation，VariantFiltering，变体，VariantToolsData，vidger，vsn，wavClusteR，XBSeq，xcms，山药，YAPSA，yriMulti，zebrafishRNASeq，zinbwave
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	BiocStyle_2.10.0.tar.gz
Windows二进制	BiocStyle_2.10.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	BiocStyle_2.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocStyle
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BiocStyle
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/BiocStyle/
软件包下载报告	下载数据